Normalerweise sollte man C und D haben. C für Windows, Programme, Spiele und D für seine Daten, mp3s etc. Bei ner Formatierung macht man dann lediglich C "platt" und muss seine Daten nicht auf diversen Datenträgern sichern.
Es macht keinen Sinn C only fürs Betriebssystem, D für Programme und Spiele und E dann für seine Daten. Die Sachen auf D schreiben auf C in die Registry. Mache ich C platt, läuft D normalerweise nicht mehr nach ner Neuinstallation.