Unter
/Extras/Einstellungen/Erweitert/Downloads
musst du den Eintrag zur Dateiendung "pdf" markieren/anklicken und anschließend auf "Bearbeiten" klicken. Dort kann man das Programm, welches Opera für pdf-Dateien verwenden soll, einstellen. Sollte bei der Windowsversion ähnlich sein.