Lief irgendein Programm zur Audio- oder Videowiedergabe in Hintergrund während der Ton bei YouTube aussetzte? Bei mir ist der Ton bei YouTube manchmal weg während foobar2000 läuft. (In dem Fall ist das allerdings gewollt, weil ich es hasse, wenn irgendein blödes Werbebanner oder -Video rumtönt während ich Musik höre.)
Ansonsten... wenn du unter Google Chrome die Konfigurationsseite für die Plug-ins (chrome://plugins/) aufrufst, was steht dort beim Adobe Flash Player?
Falls dort "Adobe Flash Player (2 files)" steht, also dass es zwei (oder mehr) Flash Player-Plugins gibt, dann klicke mal oben rechts auf "Details". Dann müssten alle verfügbaren Flashplugins angezeigt werden.
Normalerweise ist das dann zum einen das systemweite Flashplugin für die alternativen Browser (=alle Browser die nicht Internet Explorer heißen). Dieses hat seinen Speicherort irgendwo unter "C:\windows\SysWOW64\Macromed\Flash\" bzw. bei 32 Bit-Systemen "C:\Windows\System32\Macromed\Flash".
Zum anderen müsste dort die extra für Chrome entwickelte Version des Flash Player-Plugins (PepperFlash) angezeigt werden. Dessen Speicherpfad befindet in einem Unterordner des Programmordners von Google Chrome (C:\Program Files (x86)\Google\Chrome\Application\<Versionsnummer>\PepperFlash\pepflashplayer.dl).
Falls sich dort also 2 (oder mehr) Flash Player-Plugins befinden, deaktiviere davon mal alle bis auf eines und schaue nach, ob nach dem Neustart des Browsers das YouTube-Tonproblem dadurch eventuell gelöst ist. Aus Sicherheitsüberlegungen heraus würde ich das Chrome-eigene PepperFlash-Plugin anlassen und die anderen Flash Player-Plugins deaktivieren. Falls das nichts bringt, kannst du es ja mal anders herum probieren und nur eines der anderen Flash Player-Plugins aktiviert lassen. (Auf manchen Systemen funktioniert PepperFlash nicht einwandfrei.)